1970年代，二位华西神经外科的先驱——高立达、吴革，就尝试了对药物难治性癫痫进行外科切除治疗的尝试；1990年代，雷町、游潮、姜曙等医师开始尝试使用微血管减压术治疗三叉神经痛和面肌痉挛等颅神经功能疾病。这些工作为华西神经外科功能亚专业奠定了坚实的基础；2005年功能神经外科亚专业成立，由雷町医师任亚专业组长。在雷町医师的带领下，华西功能神外亚专业迅速发展；2010年前后，与神经内科、儿科、神经电生理等展开多学科协作针对神经系统专病联合治疗，大大拓宽了功能神外的治疗广度与深度。

迄止2018年，在亚专业划分后的12年，功能神经外科开展了大量的创新技术，包括：标准的前颞叶切除术、经颞中回选择性海马-杏仁核切除术、经侧裂选择性海马-杏仁核切除术、开颅硬膜下栅状电极和深部电极植入术（长程视频脑电监测用）、颞叶外癫痫灶切除术、迷走神经刺激术、胼胝体切开术、三叉神经微血管减压术、面神经微血管减压术等。

通过改革开放后四十年华西神外人不懈的努力，华西功能神外已经将药物难治性癫痫的远期（3年））外科治愈率提高到66%，将三叉神经痛的远期（5年）治愈率提高到70%以上，面肌痉挛的远期治愈率达到93%以上。而这三种疾病的围手术期死亡率分别降低到0.4%，0%和0%，手术相关并发症率控制在3-5%以内。

立体定向神经外科：包括立体定向放射外科和立体定向功能外科

1997年8月，神经外科引进德国BrainLab公司先进的X-刀系统，同时还有立体定向手术系统，由王伟医师负责临床工作，先后完成900例X-刀治疗和100台定向手术。开创了华西乃至西部该领域的先河！

2004年升级换代为瑞典Elekta公司Leksell C型伽玛刀系统，自此该亚专业不断发展壮大，至今已完成伽玛刀治疗2万余病例，立体定向及功能神经外科手术2000余例，获得国家及省部级课题10余项，发表SCI论著30余篇，取得了良好的经济效益和社会效益，已经成为全国第4位，西部第一的伽玛刀中心，牵头成立了四川医师协会放射外科专委会，引领西部放射外科蓬勃发展！

以脑深部电刺激（DBS）技术为核心的神经调控功能外科亚专业近17年来有了飞跃发展。自从2001年西部首例DBS治疗帕金森病手术在华西的成功，开创了西部神经调控的领域，在医院的大力支持下，经过内外科多科协助，各级人员的辛勤努力，我们已经发展成为西部最大的神经调控中心，在医教研各方面引领发展。完成神经调控手术1000余例。运动障碍疾病方面，创新完成亚洲首例舞蹈症手术；创新完成几十例植物人促醒术；精神外科方面，首创伏隔核联合内囊前肢刺激术治疗难治性强迫症和抑郁症，取得成功；牵头成立了中国医师协会神经调控专委会西南分委会，带领西部神经调控事业前行。国际合作方面，我们与美国科罗拉多大学神经外科签署了5年战略合作协议并联合培养研究生，目前已有1名博士生毕业。此外华西神经调控团队还远赴巴基斯坦指导开展DBS手术。

现功能神经外科亚专业组医生代表有:雷町、王伟、陈兢、方芳、李鹏、张恒、毛珂、司马秀田、李路莹。