据《中国医院院长》杂志消息  国内第一个医疗排行榜——2009年度中国最佳专科声誉和最佳医院排行榜，上周由复旦大学医院管理研究所推出，北京协和医院、四川大学华西医院、中国人民解放军总医院名列前三名；四川有两家医院进入前50名。四川大学华西医院在专项排名中以专科声誉51.45名列全国第二，科研学术20分名列全国第一，综合得分71.45分名列全国第二名；四川大学华西口腔医院，以综合得分9.26分名列41名。
        在已知的专科声誉排名中，四川大学华西医院下列临床科室上榜，具体排名如下：
        麻醉科           全国第一   
        泌尿外科       全国第二
        神经外科       全国第三 
        病理科          全国第三  
        放射科          全国第三
        精神病学      全国第四  
        普外科          全国第五
        胸心外科       全国第六
        骨科             全国第七 
        肺科             全国第七  
        内分泌          全国第七
       神经内科        全国第八
        消化科          全国第九 
        眼科             全国第九
        风湿科          全国第十