新川科技园质谱平台由医院投入建设并于2020年底正式投入使用，目前拥有Thermo Exploris 480、Thermo Q Exactive Plus、 AB Sciex 6500 Plus、AB Sciex 5500 Plus、LECO Pegasus BT共5台质谱仪和Shimadzu LC-40、Shimadzu LC-20AP色谱仪，向全院师生提供色谱和质谱类的技术服务。目前平台可提供的待测样品种类包括有机化合物、蛋白质及酶解多肽、血样、尿样、细胞样、组织样、微生物培养液、植物提取液等，可开展的分析测试工作包括成分分离分析、结构鉴定、药物定量、蛋白组学、代谢组学等。

    平台位于新川科技园疾病分子网络前沿科学中心D5栋B区二楼，平台实验面积约为500 m2，其中色谱和质谱分析区域约200 m2。平台严格按照质谱实验室建设标准配备了10万级洁净度、双排风系统、集中供气、质谱仪专线及不间断电源、专用及备用空调、稳定的温湿度控制、气体灭火等装置，为质谱仪的安全和稳定运行提供了重要保证。平台依据功能不同可分为样本处理室、色谱间、质谱间和氮气发生室四大模块，如下图所示：

    平台目前主要的质谱仪分为液质联用仪和气质联用仪两大类。液质联用仪包括Thermo Exploris 480、Thermo Q Exactive Plus、 AB Sciex 6500 Plus和AB Sciex 5500 Plus；气质联用仪有LECO Pegasus BT。其中主要用于定性分析的质谱包括：Thermo Exploris 480、Thermo Q Exactive Plus；主要用于定量分析的质谱包括：AB Sciex 6500 Plus、AB Sciex 5500 Plus和LECO Pegasus BT。小型设备有：十万分之一天平、冻干机、离心浓缩仪、旋转蒸发仪、氮吹仪、制备液相色谱等。

    平台由杜丹副研究员担任平台主管，负责平台的建设与日常运行管理。平台现有实验技术人员5名（其中具博士学位1名和硕士学位4名），负责对质谱的操作、培训和日常维护。平台技术人员具备熟练的靶向和非靶向代谢组学、非标记定量蛋白组学和生物分析技术，并建立了相应的送样、测试、分析和缴费等管理流程。

平台仪器的主要性能参数

纳升液相色谱-离子淌度-四极杆轨道阱质谱

厂商：Thermo Fisher  型号：Easy nLC1200-FAIMS-Orbitrap Exploris 480 仪器管理员：王锐

主要性能指标：

    质量范围：m/z 40-6000；分辨率：480000 （m/z ≤200）；质谱采集速率：分辨率为7500时，最高可到40 Hz （m/z 200）；动态范围：＞5000:1；检测器：采用静电轨道阱无损检测器；具有正负切换扫描功能；质量准确度（MS和MS/MS）：内标<1 ppm 外标<3 ppm；灵敏度：1）MS/MS：50 fg利血平，S/N 100:1；2）SIM：50 fg利血平，S/N 150:1。

    Exploris 480是一台具有超高分辨率的质量选择性（最高可达480000）、出类拔萃的扫描速度（高达40 Hz），高质量精度以及持久稳定性的质谱。高度智能的质谱采集策略使蛋白组学分析实现更深覆盖度（加载FAIMS使蛋白鉴定率增加10%）、更高定量准确度（CV<10%）。Exploris 480配置的Easy-nLC 1200系统具有在超高压条件下分离生物分子（如蛋白质和多肽）的独特优势。操作压力范围（0-1200 bar），液相系统的高压加速了上样和柱重新平衡的过程，提高了分析效率；不分流纳升流路功能也能提供出色的保留时间稳定性（RSD<0.4%）。配合Biopharma软件--生物药物软件和Spectro Dive蛋白组学软件具有更加广泛的应用前景。

    主要应用范围：蛋白质定性分析；血清/组织/细胞等样品的非标定量蛋白组学（DDA、DIA）；血清/组织/细胞等样品同位素标记蛋白质组学（TMT、SILAC等）；翻译后修饰（PTM）蛋白质组学。

超高效液相色谱-四极杆轨道阱质谱

厂商：Thermo Fisher 型号：Vanquish UHPLC-Q Exactive plus 仪器管理员：蒲倩伦、汪满江措

主要性能指标：

    质量范围：50-6000；分辨率：140000 （m/z ≤200）；质谱采集速率：分辨率≥70000 FWHM时，不少于3张/秒；动态范围：1e5；检测器：采用静电轨道阱无损检测器；具有正负切换扫描功能；质量准确度（MS和MS/MS）：内标<1 ppm，外标<2 ppm；灵敏度：1）MS灵敏度（分辨率保持在70000时）：质量窗口≤5 ppm，50 fg利血平，MS模式下，信噪比S/N≥500，连续进样6针，RSD≤5%；2）MS/MS灵敏度（分辨率保持在70000时）：质量窗口≤5 ppm，50 fg利血平，MS/MS模式下，信噪比S/N≥1000，连续进样6针，RSD≤5%。

    Q Exactive Plus是一台高性能高分辨质谱，检测器基于静电场轨道阱（Orbitrap）技术，真空度比传统质量分析器低3个数量级，因此具有极佳的质量稳定性。QE Plus质谱具有超高的分辨率（最高可达140,000）以及优秀的质量准确性（通常可以达到1 ppm）。可以选定目标离子进行HCD碰撞解离获得高质量的二级质谱图，具有全扫描、数据依赖型采集、反应离子监测等多种扫描模式，因此在化合物定性和定量分析上具有显著优势。配合CD软件-代谢组学分析软件和Lipidsearch--脂质组学分析软件，进一步使得该仪器拥有多组学应用潜力。

    主要应用范围：未知有机物、代谢物分析；血样、组织、细胞等的非靶向代谢组学分析；代谢流分析；质谱成像分析；mRNA加帽率分析；中药指纹图谱分析等。

超高效液相色谱-三重四级杆质谱

厂商：SCIEX   型号：UHPLC-Triple Quad™ 5500+  仪器管理员：江钠、杨沮勤

主要性能指标：

    质量范围：5-1250；四级杆分辨率：半峰宽0.6-0.7 amu；质谱扫描速率：12000 amu/s；动态范围：1e6；检测器：采用eQTM 电子学设计的AcQuRate脉冲计数检测器；具有正负切换扫描功能；质量准确度：全质量数范围0.01% amu；灵敏度：1）ESI：1 pg利血平，S/N ＞500,000:1；2）APCI：10 pg利血平，S/N ＞100,000:1。

    SCIEX Triple Quad™ 5500+系统 QTRAP® Ready拥有三重四极杆质谱的定量功能和线性离子阱质谱的定性功能。高达6个数量级的动态范围，满足从低水平的痕量残留检测到超高浓度分析物的定量检测要求。与SelexION™+差分离子淌度技术相兼容，通过改善分析物离子淌度性能实现同分异构体的选择性分离及检测，使得该仪器具有4D组学的应用前景。

    主要应用范围：有机化合物成分定量分析，如药代药动学的定量分析；动物、细胞及血液样品中靶向代谢组学及靶向脂质分析等。

超高效液相色谱-三重四级杆质谱

厂商：SCIEX  型号：UHPLC-Triple Quad™ 6500+  仪器管理员：蒲倩伦、汪满江措

主要性能指标：

    质量范围：5-2000；四极杆分辨率：半峰宽0.6-0.7 amu；质谱采集速率：12000 amu/sec；动态范围：1e6；检测器：IonDrive脉冲计数高能检测器（HED+）；具有正负切换扫描功能；质量准确度：全质量数范围0.01% amu；灵敏度：1）ESI：1 pg 利血平，S/N＞750,000:1；2）APCI：50 pg利血平，S/N ＞200,000:1。

    SCIEX Triple Quad™ 6500+ LC-MS/MS 系统采用多组分IonDrive™技术并利用全新设计的IonDrive高能检测器+ 提升性能和液质联用定量分析的灵敏度。能够分析更复杂的基质中范围更广泛的化合物，并进一步提高了仪器信噪比和定量限，适用于多组学的靶向研究。

    主要应用范围：有机化合物成分定量分析（如内源性代谢产物；药代动力学；血液中胆汁酸定量分析）；血样、组织、细胞等的靶向代谢组学和脂质组学分析；多肽定量等。

气相色谱-飞行时间质谱

厂商：LECO 型号：Pegasus BT GC-TOFMS  仪器管理员：龙怡静

主要性能指标：

    全自动代谢组学样品前处理系统；开放式免清洗免维护EI源；采集频率：3,5000 Hz；质量范围：10-1500；灵敏度：检测限 = 8 fg八氟萘；分辨率：质量精确到小数点后两位；动态范围：> 1e5；质量精度：1 pg八氟萘重复进样100次，RSD < 5%；质量轴稳定性：24小时漂移不大于0.10 amu；代谢组学一站式解决方案数据处理系统。

    Pegasus BT气相色谱联飞行时间质谱实现了全自动、高通量、一站式非靶向代谢组学分析。主要应用于临床人类和模式动物代谢组学和代谢流、TCA与糖酵解代谢物靶标定量、新生儿科有机酸代谢病辅助诊断、脂肪酸代谢疾病、感染和呼吸疾病VOCs等领域。高通量数据采集、数据处理智能化和代谢报告定制化。兼顾全代谢组学和靶向代谢定量，适合开展临床大队列研究。

    主要应用范围：挥发性成分分析；血样、组织、细胞等代谢组学研究和代谢流分析等。

    平台主管/负责人：杜 丹

    联系方式：028-61526690/成都市高新区新川路2222号成都前沿医学中心D5-B座2楼