2022年3月10日，四川大学华西医院生物治疗国家重点实验室/罕见病中心/中西医结合科孙子宜研究员、周小明研究员团队在Nature Communications上在线发表题为“An open-like conformation of the sigma-1 receptor reveals its ligand entry pathway”的研究成果，揭示了配体通过PATH2途径进入sigma-1受体的分子机制。这一研究结果对靶向调控σ1R功能来治疗多种疾病具有重要指导意义。

课题组孟富慧博士和博士研究生肖杨为共同第一作者，硕士研究生姬玉佳参与了该项研究。四川大学华西医院为第一作者单位。

Sigma-1受体（σ1R）是一类非阿片类跨膜蛋白受体，主要位于细胞的内质网膜，在人体大部分器官和组织中都有分布，介导细胞存活与多种生理活动。σ1R功能障碍与多种疾病如神经退行性疾病、癌症等相关。2016年发表的人源sigma-1受体（hσ1R）的晶体结构显示（图1左）：σ1R结构采用同源三聚体形式，每个单体包含氨基端一次跨膜螺旋（α1）、中部含配体结合位点的β-桶体和羧基端贴近膜的V形双螺旋束（α4/α5）。有观点认为配体进入σ1R的途径主要存在两种可能（图1右）：第一种可能（PATH1）认为配体通过β-桶底部进入σ1R，这一过程涉及β-桶体的打开和重形成；而第二种可能（PATH2）认为配体通过α4和α5螺旋之间的开口进入σ1R的配体结合位点。由于缺乏明确的实验证据，σ1R的配体进入途径一直存在争议。

图1. σ1R的三维构象以及配体进出受体的两种可能途径。选自原文Figure 1。

该研究使用X-射线晶体衍射技术，首次解析了非洲爪蟾σ1R（xlσ1R）分别结合内源性配体（推测）和外源性配体（激动剂PRE-084、拮抗剂S1RA）的开放性/封闭式高精度三维结构。xlσ1R的封闭式结构与hσ1R结构类似，呈同源三聚体（图2左），但其晶体堆积方式以及配体浸泡xlσ1R晶体得到的受体-配体复合物结构显示，浸泡的配体无法通过PATH1进入xlσ1R。

图2. σ1R的开放/封闭构象及α4/α5螺旋开口。选自原文Figure 3。

另一方面，xlσ1R开放性结构中α4螺旋发生旋转位移，α5螺旋上的203位酪氨酸侧链向内旋转，形成了一个允许配体通过的开口（图2右）。研究者设计二硫键突变体（L179C/Y203C）限制α4/α5螺旋的相对移动，并利用等温滴定量热法（ITC）测定配体与xlσ1R的结合参数，结果显示配体结合受限（图3）。另外，通过化学修饰增加开口处的空间位阻发现配体-受体结合受限程度与开口处空间阻碍程度相符。此结果为配体通过PATH2进入σ1R提供了有力证据。

图3. xlσ1R入口突变及配体结合实验。选自原文Figure 4。

综上所述，该研究通过X-射线晶体衍射技术解析了非洲爪蟾σ1R开放性结构，支持σ1R配体通过α4和α5螺旋之间的开口（PATH2途径）进入受体β-桶内的配体结合位点这一观点。ITC测定了此开口正常和受限状态下受体与配体间结合参数的变化，进一步验证了文章论点。该研究结果对靶向调控σ1R功能来治疗多种疾病具有重要指导意义。

原文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-022-28946-w